Rupiah Banda kết hôn với người vợ đầu tiên, Hope Mwansa Makulu, vào năm 1966 và họ có với nhau 3 người con trai.[13] Hope Mwansa Banda (sinh ngày 29 tháng 8 năm 1941), qua đời tại Nam Phi vào ngày 11 tháng 10 năm 2000.[13] Bà được chôn cất tại Nghĩa trang Đồi Leopards.[13] Người vợ thứ hai của ông, Thandiwe Banda, một giáo viên khoa học chính trị, kém ông hơn 30 tuổi.[14][15] Thandiwe Banda từng là Đệ nhất phu nhân Zambia trong nhiệm kỳ tổng thống của ông từ năm 2008 đến năm 2011.[15] Ngoài các con trai với người vợ đầu tiên, Hope Mwansa Banda, Banda còn có hai con trai từ các mối quan hệ trước đó và một cặp sinh đôi từ cuộc hôn nhân với Thandiwe Banda.[16]